More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1379 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 365 aa  724    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  69.21 
 
 		 366 aa  501  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  68.12 
 
 		 367 aa  488  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0324  transcription elongation factor NusA  63.11 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0485  transcription elongation factor NusA  62.57 
 
 		 362 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0510  transcription elongation factor NusA  62.57 
 
 		 362 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1479  transcription elongation factor NusA  62.3 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  60.16 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  58.7 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  54.88 
 
 		 380 aa  391  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  38.19 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1262  transcription elongation factor NusA  35.24 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  37.75 
 
 		 517 aa  191  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  36.6 
 
 		 517 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  35.74 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  36.04 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  35.14 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  37.87 
 
 		 536 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  36.41 
 
 		 520 aa  184  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  34.95 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  36.09 
 
 		 572 aa  182  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  37.06 
 
 		 537 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  34.13 
 
 		 421 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  34.64 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  35.14 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  37.65 
 
 		 536 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  37.35 
 
 		 538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  37.06 
 
 		 541 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  36.09 
 
 		 552 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  35.8 
 
 		 344 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  36.04 
 
 		 449 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  35.21 
 
 		 538 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  36.39 
 
 		 544 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  35.74 
 
 		 533 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  36.34 
 
 		 535 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  36.09 
 
 		 537 aa  179  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  36.09 
 
 		 537 aa  179  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  37.06 
 
 		 539 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 503 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  33.52 
 
 		 498 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  36.79 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  34.69 
 
 		 506 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  34.62 
 
 		 532 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  34.93 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  32.54 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  34.34 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  35.21 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  33.43 
 
 		 495 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  34.34 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  36.18 
 
 		 537 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  33.13 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  36.76 
 
 		 540 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  36.09 
 
 		 535 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  33.73 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  35.12 
 
 		 490 aa  177  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  32.19 
 
 		 392 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 501 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  36.09 
 
 		 534 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  35.8 
 
 		 536 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  32.66 
 
 		 393 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  32.74 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  35.12 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  35.44 
 
 		 538 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  35.21 
 
 		 560 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  33.93 
 
 		 495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  35.14 
 
 		 506 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  36.04 
 
 		 516 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  34.91 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  35.5 
 
 		 545 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  32.23 
 
 		 449 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  33.73 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  34.81 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  34.23 
 
 		 531 aa  172  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  36.61 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  34.33 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  33.52 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 491 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  35.44 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  35.5 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  32.84 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  33.63 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  34.43 
 
 		 497 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  33.12 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  37.09 
 
 		 537 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  33.98 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  32.73 
 
 		 491 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1246  NusA antitermination factor  32.86 
 
 		 494 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0519661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>