293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0581 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0581  putative transport protein  100 
 
 		 380 aa  744    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0834  major facilitator transporter  53.95 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1683  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1469  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0747  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2295  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.855468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  28.77 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  28.77 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 421 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 414 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  28.53 
 
 		 417 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  27.78 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  28.26 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 425 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  28.26 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  28.26 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2537  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128789  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  25.57 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 434 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  25.43 
 
 		 438 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0770  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  25.14 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 481 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  25.59 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 434 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  24.57 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 410 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 499 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  26.33 
 
 		 537 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 407 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  27.41 
 
 		 526 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  25.56 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  24.79 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  25.41 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 406 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 433 aa  86.3  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  22.32 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  21.16 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  21.67 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  23.42 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  22.81 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  21.24 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  20.95 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>