119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1568 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1568  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2020  DNA polymerase III subunit delta'  68.14 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1114  DNA polymerase III subunit delta'  49.75 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1001  DNA polymerase III subunit delta'  49.25 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1085  DNA polymerase III subunit delta'  48.02 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.85483  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0687  DNA polymerase III subunit delta'  47.03 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.714186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0612  DNA polymerase III subunit delta'  47.03 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1375  putative DNA polymerase III delta prime subunit HolB  45.05 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000928003  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0671  DNA polymerase III subunit delta'  36.74 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.737257  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1648  DNA polymerase III subunit delta'  32.67 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00316368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 320 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  32.33 
 
 		 326 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.23 
 
 		 678 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 855 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 765 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 841 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 		 327 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 715 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  39.44 
 
 		 312 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0075  DNA polymerase III gamma/tau subunit  44.23 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 692 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.13 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.29 
 
 		 812 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 1078 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  31.88 
 
 		 727 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 351 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 729 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 1202 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  33.33 
 
 		 1159 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.28 
 
 		 363 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.28 
 
 		 363 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.21 
 
 		 322 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 878 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.58 
 
 		 520 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.43 
 
 		 732 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 712 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.43 
 
 		 863 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.78 
 
 		 690 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 960 aa  45.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.88 
 
 		 872 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  31.91 
 
 		 323 aa  45.1  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 713 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.88 
 
 		 1122 aa  45.1  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 743 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  26.36 
 
 		 328 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 737 aa  45.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  41.18 
 
 		 382 aa  44.7  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.36 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  38.96 
 
 		 390 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  33.33 
 
 		 801 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1189  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.19 
 
 		 366 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 926 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.73 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  34.02 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.56 
 
 		 462 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  38.03 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  40.38 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 637 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.99 
 
 		 808 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  30.16 
 
 		 335 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.99 
 
 		 834 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  56.1 
 
 		 330 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.5 
 
 		 360 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.58 
 
 		 320 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0203  DNA polymerase III delta' subunit  43.55 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  54.29 
 
 		 341 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  54.29 
 
 		 341 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.83 
 
 		 336 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 872 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  38.03 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  51.11 
 
 		 361 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.38 
 
 		 335 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  45.65 
 
 		 370 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  45.65 
 
 		 373 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.48 
 
 		 391 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.16 
 
 		 312 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  60.61 
 
 		 360 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  60.61 
 
 		 363 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  60.61 
 
 		 360 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.62 
 
 		 336 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0875  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  41.27 
 
 		 379 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  33.33 
 
 		 796 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  38.03 
 
 		 389 aa  43.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  45.65 
 
 		 370 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  36.84 
 
 		 391 aa  42.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.11 
 
 		 939 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  55.56 
 
 		 394 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  29.47 
 
 		 349 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  60.61 
 
 		 347 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0793  hypothetical protein  31.68 
 
 		 348 aa  42.7  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0073979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  47.83 
 
 		 348 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.41 
 
 		 383 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6089  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  30.77 
 
 		 371 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  42.59 
 
 		 389 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  51.43 
 
 		 346 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  54.55 
 
 		 298 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  52.78 
 
 		 326 aa  42  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.43 
 
 		 690 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  51.35 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>