154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09338 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09338  hypothetical protein  100 
 
 		 970 aa  2004    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446903  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4953  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.72 
 
 		 687 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2387  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  25.45 
 
 		 625 aa  87.8  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0947705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.2 
 
 		 891 aa  70.5  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.5 
 
 		 835 aa  69.7  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.75 
 
 		 840 aa  68.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  26.92 
 
 		 907 aa  65.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.93 
 
 		 902 aa  65.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  24.77 
 
 		 891 aa  65.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  25.43 
 
 		 726 aa  64.7  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  23.16 
 
 		 887 aa  62.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.66 
 
 		 884 aa  62.4  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  24.4 
 
 		 781 aa  62  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  24.32 
 
 		 892 aa  62  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  23.01 
 
 		 869 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  27.57 
 
 		 885 aa  61.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.78 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  22.74 
 
 		 868 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  22.84 
 
 		 868 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  24.17 
 
 		 788 aa  60.1  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.77 
 
 		 887 aa  60.1  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3872  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like  22.83 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53722  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  24.89 
 
 		 866 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  22.96 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  27.88 
 
 		 779 aa  58.2  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  21.89 
 
 		 780 aa  57.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  24.84 
 
 		 754 aa  57.4  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  22.36 
 
 		 809 aa  57.4  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  22.7 
 
 		 868 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  27.05 
 
 		 869 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  27.19 
 
 		 885 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  24.24 
 
 		 871 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  21.34 
 
 		 810 aa  57  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  27.62 
 
 		 868 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  24.42 
 
 		 795 aa  55.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  24.7 
 
 		 760 aa  55.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  25.11 
 
 		 812 aa  55.5  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  23.79 
 
 		 275 aa  55.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  23.38 
 
 		 868 aa  55.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  25.24 
 
 		 868 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.56 
 
 		 950 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  28.67 
 
 		 800 aa  54.7  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  23.69 
 
 		 757 aa  54.7  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  25.19 
 
 		 795 aa  54.3  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  24.58 
 
 		 795 aa  53.9  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.97 
 
 		 873 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.28 
 
 		 887 aa  54.3  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  21.7 
 
 		 758 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  31.72 
 
 		 805 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  26.76 
 
 		 789 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  24.65 
 
 		 809 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25 
 
 		 692 aa  53.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.66 
 
 		 725 aa  53.5  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  21.92 
 
 		 758 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  22.32 
 
 		 785 aa  53.5  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  22.49 
 
 		 785 aa  53.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 		 764 aa  53.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.12 
 
 		 302 aa  52.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  24.39 
 
 		 762 aa  52.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  21.78 
 
 		 868 aa  52  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  21.78 
 
 		 868 aa  52  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  22.22 
 
 		 758 aa  52  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  25.94 
 
 		 971 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.22 
 
 		 821 aa  52  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 805 aa  51.6  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  30.77 
 
 		 874 aa  51.6  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.82 
 
 		 386 aa  51.6  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  25.69 
 
 		 825 aa  51.2  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  24.21 
 
 		 868 aa  51.2  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  25.86 
 
 		 810 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  24.73 
 
 		 815 aa  51.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  22.44 
 
 		 824 aa  51.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87084  predicted protein  25.14 
 
 		 997 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.019106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  27.66 
 
 		 799 aa  50.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  21.41 
 
 		 758 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  27.97 
 
 		 789 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  28.67 
 
 		 790 aa  50.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  26.06 
 
 		 782 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  21.4 
 
 		 842 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  21.4 
 
 		 842 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  22.97 
 
 		 359 aa  49.7  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  24.08 
 
 		 898 aa  49.7  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  27.66 
 
 		 792 aa  49.7  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  30.97 
 
 		 790 aa  49.3  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  24.23 
 
 		 906 aa  49.3  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  23.04 
 
 		 812 aa  49.3  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  23.04 
 
 		 1115 aa  49.3  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  25.85 
 
 		 794 aa  48.9  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  26.06 
 
 		 366 aa  48.9  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  28.65 
 
 		 796 aa  48.9  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.66 
 
 		 852 aa  48.9  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  21.37 
 
 		 758 aa  48.9  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 803 aa  48.9  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  21.08 
 
 		 414 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0548  phosphoenolpyruvate synthase  26.95 
 
 		 799 aa  48.9  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.485187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  22.48 
 
 		 805 aa  48.5  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  26.92 
 
 		 890 aa  48.5  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  24.57 
 
 		 804 aa  48.5  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  26.24 
 
 		 797 aa  48.5  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  23.42 
 
 		 837 aa  48.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>