181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2387 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2387  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
625 aa  1273    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0947705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3872  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like  34.95 
 
 
656 aa  399  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53722  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4953  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.37 
 
 
687 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87084  predicted protein  26.33 
 
 
997 aa  97.8  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.019106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09338  hypothetical protein  25.45 
 
 
970 aa  87.8  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446903  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32991  predicted protein  21.99 
 
 
918 aa  73.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0660064  normal  0.166301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  24.75 
 
 
781 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  22.92 
 
 
868 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  24.1 
 
 
865 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  28.04 
 
 
825 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.99 
 
 
873 aa  64.3  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  22.85 
 
 
792 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  22.26 
 
 
871 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  23.15 
 
 
792 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  22.62 
 
 
868 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  22.62 
 
 
868 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  22.32 
 
 
869 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.32 
 
 
725 aa  62  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  22.75 
 
 
810 aa  61.6  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  21.96 
 
 
794 aa  61.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  22.12 
 
 
870 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  21.96 
 
 
794 aa  61.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  21.96 
 
 
794 aa  61.2  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  21.1 
 
 
835 aa  60.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  24.33 
 
 
789 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  19.83 
 
 
840 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  23.44 
 
 
792 aa  58.9  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  24.33 
 
 
789 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  24.33 
 
 
789 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.66 
 
 
302 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  24.33 
 
 
789 aa  58.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  29.23 
 
 
1115 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  22.29 
 
 
792 aa  57  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  23.38 
 
 
971 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  22.87 
 
 
782 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  22.38 
 
 
792 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  22.38 
 
 
792 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  22.38 
 
 
792 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  22.55 
 
 
792 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  23.44 
 
 
808 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  22.38 
 
 
792 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  22.38 
 
 
792 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  27.66 
 
 
364 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  22.38 
 
 
792 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  22.38 
 
 
792 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  21.8 
 
 
792 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  22.62 
 
 
868 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  22.32 
 
 
868 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.1 
 
 
950 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.78 
 
 
821 aa  55.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  23.4 
 
 
762 aa  54.7  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 
789 aa  54.7  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  22.5 
 
 
798 aa  53.9  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  21.73 
 
 
762 aa  53.9  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  22.16 
 
 
812 aa  53.9  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  26.04 
 
 
801 aa  53.9  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  25.52 
 
 
791 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  22.38 
 
 
791 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  27.18 
 
 
842 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  22.38 
 
 
791 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.43 
 
 
852 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  21.7 
 
 
826 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 
800 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  23.15 
 
 
791 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  21.8 
 
 
792 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  21.63 
 
 
907 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  21.8 
 
 
792 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  22.09 
 
 
792 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  24.48 
 
 
789 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  23.96 
 
 
798 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  24.23 
 
 
789 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  22.54 
 
 
790 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2388  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.49 
 
 
812 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  22.67 
 
 
795 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  21.75 
 
 
790 aa  51.6  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  24.48 
 
 
789 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.19 
 
 
869 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  24.48 
 
 
789 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  22.05 
 
 
794 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  22.46 
 
 
810 aa  51.6  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  23.81 
 
 
789 aa  51.2  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  23.51 
 
 
790 aa  51.2  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  21.41 
 
 
791 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  22.09 
 
 
792 aa  51.2  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  21.36 
 
 
903 aa  51.2  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  22.67 
 
 
791 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  23.44 
 
 
414 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  23.81 
 
 
809 aa  50.8  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  22.74 
 
 
805 aa  50.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  21.47 
 
 
800 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.86 
 
 
887 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  21.51 
 
 
792 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  21.51 
 
 
792 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  23.05 
 
 
796 aa  50.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  22.67 
 
 
795 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  21.51 
 
 
792 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  23.05 
 
 
796 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  21.78 
 
 
789 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  20.94 
 
 
869 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  25.52 
 
 
799 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>