More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01430 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01430  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
283 aa  584  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0825  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 
292 aa  319  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1507  pantoate/beta-alanine ligase  46.32 
 
 
280 aa  263  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0477  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 
281 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  44.29 
 
 
280 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  44.62 
 
 
280 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.37 
 
 
279 aa  223  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  39.22 
 
 
283 aa  211  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.24 
 
 
526 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  40.22 
 
 
278 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  38.43 
 
 
279 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  39.3 
 
 
286 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  40.71 
 
 
281 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  39.49 
 
 
278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  38.08 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  38.38 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  37.59 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.51 
 
 
511 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.51 
 
 
511 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  39.44 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  39.3 
 
 
280 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  39.3 
 
 
280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.7 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3689  pantoate/beta-alanine ligase  37.32 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  37 
 
 
289 aa  195  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  38.73 
 
 
282 aa  195  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  40.61 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  40.45 
 
 
539 aa  194  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.67 
 
 
529 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  37.23 
 
 
279 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.66 
 
 
280 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  37.81 
 
 
281 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 
282 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  38.16 
 
 
286 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.31 
 
 
282 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  36.4 
 
 
289 aa  191  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.49 
 
 
527 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  37.76 
 
 
283 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  39.24 
 
 
284 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  37.1 
 
 
288 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.59 
 
 
528 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  38.49 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  40 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  39.36 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  40.88 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  36.84 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  40 
 
 
293 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  37.63 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  37.5 
 
 
283 aa  188  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  38.16 
 
 
287 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  36.59 
 
 
291 aa  188  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  38.6 
 
 
281 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  37.8 
 
 
287 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  39.64 
 
 
283 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  39.5 
 
 
289 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  36.73 
 
 
284 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  38.52 
 
 
300 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  37.89 
 
 
281 aa  186  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  40.44 
 
 
291 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  39.25 
 
 
283 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  37.11 
 
 
287 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.15 
 
 
534 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  38.64 
 
 
304 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  39.25 
 
 
283 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  39.02 
 
 
283 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  38.15 
 
 
288 aa  185  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  39.02 
 
 
283 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  39.02 
 
 
283 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  39.02 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  39.39 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  39.02 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  39.02 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  39.02 
 
 
283 aa  185  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  39.02 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  37.87 
 
 
284 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  36.88 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  37.32 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  37.11 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  37.45 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  35.69 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  39.49 
 
 
314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  37.99 
 
 
283 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  38.18 
 
 
282 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  39.02 
 
 
334 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  37.99 
 
 
283 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  35.69 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  36.04 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  35.21 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  38.31 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  36.59 
 
 
280 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  36.71 
 
 
283 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  36.71 
 
 
283 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  41.86 
 
 
280 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  39.62 
 
 
277 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  35.71 
 
 
298 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1644  pantoate/beta-alanine ligase  38.16 
 
 
295 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  36.27 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  38.06 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  36.62 
 
 
288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  37.36 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>