86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2876 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  90.13 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  68.32 
 
 
306 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  53.87 
 
 
278 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  35.76 
 
 
286 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  32.91 
 
 
288 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  82.86 
 
 
278 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  82.86 
 
 
278 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  86.84 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  86.84 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  86.84 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  86.84 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  86.84 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  86.84 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  86.84 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  85.53 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  77.27 
 
 
285 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  32.6 
 
 
279 aa  112  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  85.33 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  33.59 
 
 
245 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  33.33 
 
 
268 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  84.29 
 
 
281 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  82.86 
 
 
273 aa  99  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  34.63 
 
 
215 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  32.95 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  29.84 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  31.31 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  29.88 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1978  hypothetical protein  47.06 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  53.25 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  33.6 
 
 
230 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  29.92 
 
 
257 aa  59.3  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  27.48 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  28.75 
 
 
250 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  27.39 
 
 
250 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  35.29 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  27.7 
 
 
281 aa  56.2  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  29.32 
 
 
274 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  25.33 
 
 
208 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  32.67 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  28.2 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  47.73 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  26.77 
 
 
223 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  24.74 
 
 
275 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  26.3 
 
 
224 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  47.73 
 
 
290 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  28.33 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  27.31 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  40.58 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  51.16 
 
 
249 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  23.05 
 
 
210 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  26.24 
 
 
224 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  27.31 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  25.57 
 
 
224 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  25.57 
 
 
224 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  27.17 
 
 
221 aa  49.3  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  24.38 
 
 
198 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  26.81 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  25.19 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  24.32 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  31.07 
 
 
201 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  32.63 
 
 
328 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  26.14 
 
 
267 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  45.31 
 
 
370 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  27.69 
 
 
740 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  28.63 
 
 
232 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  25.98 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  25.98 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  23.69 
 
 
194 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  25.98 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  25.98 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  25.98 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  25.98 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  25.98 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  25.98 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2218  sporulation domain-containing protein  36.11 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  27.2 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  25.98 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0252  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6008  hypothetical protein  40 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3328  sporulation domain-containing protein  27.55 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0280  sporulation domain-containing protein  38.46 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  25.77 
 
 
240 aa  42.7  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  25.77 
 
 
240 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  28.33 
 
 
214 aa  42.4  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>