More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1417 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  51.7 
 
 		 304 aa  319  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  48.5 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  48.29 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  49.5 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  47.93 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  46.26 
 
 		 303 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  45.67 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  44.56 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  46.18 
 
 		 306 aa  262  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  43.58 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  46.28 
 
 		 301 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  45.33 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  43.15 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  45.27 
 
 		 301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  45.83 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  43.79 
 
 		 309 aa  251  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  42.81 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  43.29 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  43.29 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  43.29 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  43 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  43.79 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  43.79 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  44.14 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.14 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.14 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.14 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  44.14 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  43.79 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  42.66 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  41.67 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  39.67 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  42.27 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  42.03 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  37.84 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  41.02 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  35.86 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  36.49 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  30.9 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  32.11 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  36.76 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  32.11 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  36.41 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  35.12 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  35.95 
 
 		 289 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  30.5 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  36.41 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  35.92 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4039  dihydrodipicolinate synthetase  35.92 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  33.6 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3930  dihydrodipicolinate synthetase  35.78 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  31.67 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  30.22 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  30.22 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  32.92 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.58 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  32.64 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  35.15 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  33.19 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  30.64 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.08 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  29.14 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  29.47 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  30.83 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>