More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1189 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1189  ABC molybdenum transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  100 
 
 
620 aa  1226    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0831674  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8651  ABC transporter related  48.65 
 
 
615 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  32.79 
 
 
602 aa  227  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.55 
 
 
628 aa  217  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  32 
 
 
601 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.55 
 
 
604 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
616 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 
604 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.36 
 
 
615 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  43.77 
 
 
361 aa  176  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  42.79 
 
 
343 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  44.36 
 
 
361 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  39.66 
 
 
353 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  43.44 
 
 
353 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  41.96 
 
 
368 aa  173  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.56 
 
 
379 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  41.98 
 
 
359 aa  171  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  39.77 
 
 
367 aa  171  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.78 
 
 
363 aa  170  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  39 
 
 
367 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  39 
 
 
367 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  36.67 
 
 
373 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 
369 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  39.85 
 
 
367 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  43.39 
 
 
362 aa  168  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.39 
 
 
349 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  40.08 
 
 
367 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.69 
 
 
341 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  39.69 
 
 
367 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  39.69 
 
 
367 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  39.69 
 
 
367 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.23 
 
 
359 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  32.74 
 
 
354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2987  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.94 
 
 
366 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238574  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.23 
 
 
386 aa  165  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  33.58 
 
 
352 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
343 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.46 
 
 
370 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
381 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  38.7 
 
 
368 aa  164  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  37.09 
 
 
365 aa  164  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 
376 aa  163  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  42.86 
 
 
329 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  42.79 
 
 
329 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.86 
 
 
372 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  44.34 
 
 
375 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.59 
 
 
349 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  42.79 
 
 
329 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1343  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.19 
 
 
378 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  38.99 
 
 
366 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 
244 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.22 
 
 
357 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  41.44 
 
 
350 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0998  ABC transporter related  39.35 
 
 
371 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  41.35 
 
 
398 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.53 
 
 
373 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.13 
 
 
381 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  33.02 
 
 
349 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  39.46 
 
 
369 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 
353 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.86 
 
 
329 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  35.78 
 
 
368 aa  161  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  43.4 
 
 
368 aa  161  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  42.79 
 
 
329 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2302  ABC transporter related  39.71 
 
 
357 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.996895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  45.15 
 
 
632 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  37.07 
 
 
355 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.28 
 
 
372 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  35.69 
 
 
357 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
364 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  37.74 
 
 
366 aa  160  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 
333 aa  160  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  30.35 
 
 
333 aa  160  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  35.46 
 
 
349 aa  160  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 
365 aa  160  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.86 
 
 
355 aa  160  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  39.19 
 
 
366 aa  160  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  38.53 
 
 
366 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
358 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 
363 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.55 
 
 
366 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 
366 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  35.44 
 
 
357 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 
363 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  34.68 
 
 
355 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  35.64 
 
 
347 aa  159  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.07 
 
 
352 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.52 
 
 
365 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 
333 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  29.78 
 
 
385 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  39.52 
 
 
365 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  39.52 
 
 
365 aa  159  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.85 
 
 
352 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  39.52 
 
 
365 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.55 
 
 
399 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  40 
 
 
363 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  39.52 
 
 
365 aa  159  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.61 
 
 
352 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 
370 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>