241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0791 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  82.48 
 
 
500 aa  809    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  91.85 
 
 
491 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  100 
 
 
493 aa  962    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  98.17 
 
 
493 aa  950    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  65.5 
 
 
502 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  65.5 
 
 
502 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  65.16 
 
 
491 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  64.18 
 
 
498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  65.8 
 
 
491 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  64.36 
 
 
491 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  59.96 
 
 
507 aa  528  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  57.41 
 
 
516 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  57.61 
 
 
516 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  55.71 
 
 
516 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  56.94 
 
 
516 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  56.12 
 
 
516 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  55.51 
 
 
516 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  55.51 
 
 
516 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  55.72 
 
 
503 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  57.51 
 
 
516 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  57.51 
 
 
516 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  56.12 
 
 
516 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  57.51 
 
 
516 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  57.51 
 
 
516 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  57.51 
 
 
516 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  57.51 
 
 
516 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  55.9 
 
 
516 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  54.22 
 
 
509 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  56.52 
 
 
516 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  55.89 
 
 
516 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  56.53 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  54.41 
 
 
500 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  52.27 
 
 
547 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  49.8 
 
 
554 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  48.92 
 
 
549 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  53.88 
 
 
527 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  54.25 
 
 
546 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  52.16 
 
 
529 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  48.37 
 
 
572 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  40.79 
 
 
530 aa  350  3e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  38.92 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  44.9 
 
 
515 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  39.29 
 
 
520 aa  300  3e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  46.56 
 
 
506 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  38.41 
 
 
492 aa  293  6e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  33.9 
 
 
488 aa  271  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  29.96 
 
 
490 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  30.38 
 
 
490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  29.47 
 
 
486 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  29.05 
 
 
486 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  30.41 
 
 
490 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  28.16 
 
 
490 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  29.11 
 
 
490 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  31.08 
 
 
492 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  29.31 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.9 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  29.25 
 
 
486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  29.09 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  29.09 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  29.09 
 
 
490 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  29.75 
 
 
490 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  29.09 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  28.54 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  28.19 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  29.36 
 
 
490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  29.38 
 
 
490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  29.72 
 
 
486 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  27.9 
 
 
486 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  29.07 
 
 
460 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  28.95 
 
 
490 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  27.29 
 
 
464 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  27.35 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  29.43 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  25.99 
 
 
492 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  24.41 
 
 
492 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  28.07 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  26.57 
 
 
495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.19 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.19 
 
 
486 aa  141  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  25.53 
 
 
461 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  26.19 
 
 
486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  28.12 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  27.21 
 
 
461 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  27.37 
 
 
463 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  26.87 
 
 
460 aa  107  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  23.98 
 
 
507 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  24.84 
 
 
503 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  22.58 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  24.02 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  22.99 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.54 
 
 
524 aa  67.4  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  23.38 
 
 
494 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  23.72 
 
 
516 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.88 
 
 
516 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  23.92 
 
 
483 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  23.72 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  23.72 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.72 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  23.72 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  23.72 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>