176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0603 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  93.57 
 
 		 343 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 343 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  75 
 
 		 359 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  75.52 
 
 		 345 aa  535  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  71.68 
 
 		 358 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  41.71 
 
 		 483 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  40.74 
 
 		 479 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  40.74 
 
 		 479 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  41.02 
 
 		 491 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  39.51 
 
 		 479 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  40.29 
 
 		 485 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  40.15 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 777 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  40.29 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 844 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  37.62 
 
 		 791 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 810 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 791 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 791 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  39.05 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  36.23 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  32.39 
 
 		 347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  38.08 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  29.49 
 
 		 775 aa  180  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  33.99 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  33.99 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  33.99 
 
 		 438 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  34.62 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  34.01 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  36.26 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  35.4 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  30.32 
 
 		 439 aa  165  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  32.95 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  34.11 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  34.72 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  30.92 
 
 		 484 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  32.73 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  34.14 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  32.14 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  31.53 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  29.7 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  32.01 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  34.83 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  32.64 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  32.19 
 
 		 416 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  31.93 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  31.93 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.14 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  33.43 
 
 		 363 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  32.82 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  29.46 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  30.46 
 
 		 498 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  34.69 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  31.82 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  32.72 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  32.41 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  31.13 
 
 		 479 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  31.58 
 
 		 412 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.01 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  29.91 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.63 
 
 		 314 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.73 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  33.45 
 
 		 314 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  31.04 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  31.04 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.75 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  33.08 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  30.29 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  31.58 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  30.56 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  29.56 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  32.57 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  29.52 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  31.21 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  29.87 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  28.48 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  30.26 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  32.7 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  30.74 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  30.36 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  31.62 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  30.63 
 
 		 298 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  30.56 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  30.61 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  30.61 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  30.61 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  28.25 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  27.33 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  35.15 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  29.35 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  30.28 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  27.24 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  25.93 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  30.99 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  32.54 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  28.17 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  30.42 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  26.48 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  28.17 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  30.08 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>