More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3934 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  842    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  83.25 
 
 		 437 aa  696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  83.25 
 
 		 437 aa  696    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  67.45 
 
 		 439 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  68.63 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  51.23 
 
 		 405 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  45.15 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 412 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 		 411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  39.49 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 420 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  38.57 
 
 		 425 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  38.36 
 
 		 522 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 615 aa  109  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  31.64 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.18 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.92 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  21.71 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  21.43 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  24.62 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  21.14 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  21.14 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  21.14 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  20.86 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  20.86 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  20.86 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  20.86 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  20.86 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.47 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.06 
 
 		 538 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  22.39 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.51 
 
 		 507 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.77 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 517 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.03 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 420 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 388 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.75 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  24.31 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.31 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  27.23 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  29.21 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  28.68 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.53 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  20.36 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  24.31 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 513 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>