More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3597 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 356 aa  725    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3029  HpcH/HpaI aldolase  87.08 
 
 		 329 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2208  HpcH/HpaI aldolase  72.92 
 
 		 341 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1434  HpcH/HpaI aldolase  74.92 
 
 		 332 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2431  HpcH/HpaI aldolase  68.48 
 
 		 339 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2789  HpcH/HpaI aldolase  72.42 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.175467  normal  0.257367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2279  HpcH/HpaI aldolase  72.42 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1804  putative citrate lyase beta subunit  64.24 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2173  putative lyase  55.19 
 
 		 337 aa  358  9e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2709  putative lyase  54.3 
 
 		 350 aa  342  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4357  HpcH/HpaI aldolase  50.76 
 
 		 340 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2899  lyase  49.54 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2154  HpcH/HpaI aldolase  49.24 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6859  HpcH/HpaI aldolase  49.24 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2868  malyl-CoA lyase or citrate lyase, beta subunit  48.02 
 
 		 327 aa  291  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0657  lyase, putative  51.19 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1830  HpcH/HpaI aldolase  47.42 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.650441 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2475  putative lyase  50.89 
 
 		 339 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1826  putative lyase  50.89 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1618  putative lyase  50.89 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2337  putative lyase  50.89 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0496  putative lyase  50.89 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2553  HpcH/HpaI aldolase  48.05 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3597  HpcH/HpaI aldolase  49.7 
 
 		 335 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4436  HpcH/HpaI aldolase  49.7 
 
 		 378 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3931  HpcH/HpaI aldolase  49.7 
 
 		 378 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1999  lyase protein  50 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1752  putative lyase  51.37 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2490  HpcH/HpaI aldolase  47.72 
 
 		 326 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2155  citrate lyase beta subunit-like  50.15 
 
 		 335 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4429  Citrate lyase subunit beta-like protein  44.23 
 
 		 373 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00516467  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2328  putative citrate lyase beta subunit  48.02 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4148  putative citrate lyase  44.58 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3824  HpcH/HpaI aldolase  49.41 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3308  HpcH/HpaI aldolase  49.11 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4652  HpcH/HpaI aldolase  49.4 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0797  putative lyase  52.13 
 
 		 307 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4731  HpcH/HpaI aldolase  41.12 
 
 		 334 aa  258  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  28.47 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  32.25 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  30.5 
 
 		 379 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  30.14 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  30.14 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.35 
 
 		 282 aa  96.3  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  28.57 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  27.99 
 
 		 320 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  34.11 
 
 		 287 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  29.02 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  31.08 
 
 		 277 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  30.28 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  32.52 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  28.72 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  28.72 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  28.37 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  29.58 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  28.72 
 
 		 325 aa  86.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  27.24 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  31.25 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  28.32 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  28.32 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  26.95 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  26.78 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  26.07 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  29.3 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  27.14 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  35.26 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  28.03 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  27 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  26.52 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  25.77 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  30 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  35.51 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  27.11 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  26.56 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  26.56 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  32.07 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  28.95 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  28.83 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  27.02 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  25.43 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  28.95 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  25.57 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  31.15 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  31.15 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  26.32 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  27.05 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  34.17 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  25.19 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  27.7 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  26.71 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  29.5 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  31.74 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  28.21 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  30.32 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  30.94 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  27.5 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  30.46 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  30.62 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  28.34 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  28.23 
 
 		 278 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>