More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2802 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2802  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.540476  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6742  putative PAS/PAC sensor protein  72.54 
 
 		 143 aa  220  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.63921  normal  0.585827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2761  putative PAS/PAC sensor protein  70.42 
 
 		 143 aa  217  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4662  PAS  69.44 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4485  putative PAS/PAC sensor protein  70.29 
 
 		 145 aa  210  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3616  putative PAS/PAC sensor protein  66.9 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0488  putative PAS/PAC sensor protein  63.82 
 
 		 148 aa  204  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4841  putative PAS/PAC sensor protein  67.39 
 
 		 143 aa  203  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1206  PAS sensor protein  68.09 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1366  putative PAS/PAC sensor protein  68.09 
 
 		 149 aa  201  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1145  putative PAS/PAC sensor protein  66.67 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4051  putative PAS/PAC sensor protein  65.67 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5581  putative PAS/PAC sensor protein  66.17 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.595222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0639  putative PAS/PAC sensor protein  59.42 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2500  putative PAS/PAC sensor protein  59.56 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3857  putative PAS/PAC sensor protein  53.73 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.759378  normal  0.914632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0993  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2168  putative PAS/PAC sensor protein  54.01 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.242596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5550  putative PAS/PAC sensor protein  55.28 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1710  putative PAS/PAC sensor protein  52.94 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.010044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1781  putative PAS/PAC sensor protein  52.94 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0483  putative PAS/PAC sensor protein  48.15 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000401014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0466  putative PAS/PAC sensor protein  48.15 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.98341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0282  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.283126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0362  putative PAS/PAC sensor protein  51.2 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  54.39 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3172  putative PAS/PAC sensor protein  49.23 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.920236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3152  sensory box protein  45.71 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2658  putative PAS/PAC sensor protein  46.4 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0298  putative PAS/PAC sensor protein  44.7 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.169835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0214  putative PAS/PAC sensor protein  44.7 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3701  putative PAS/PAC sensor protein  43.51 
 
 		 145 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1034  putative PAS/PAC sensor protein  40.77 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1202  putative PAS/PAC sensor protein  41.04 
 
 		 144 aa  124  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1568  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683844  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 1589 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 692 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 1374 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3803  PAS  36.13 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1721 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  32.37 
 
 		 684 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  32.82 
 
 		 1154 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  34.07 
 
 		 732 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 1969 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 873 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 781 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 1158 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  28.24 
 
 		 557 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 851 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3530  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.2 
 
 		 654 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  29.29 
 
 		 965 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 909 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 966 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 695 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0076  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.62 
 
 		 898 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 713 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 657 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 620 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 		 1119 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  30.88 
 
 		 823 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5232  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 698 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 979 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 521 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.08 
 
 		 1248 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 455 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.06 
 
 		 921 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 881 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 1300 aa  63.5  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 520 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 907 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 857 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1313 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 457 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1000 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 964 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 960 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  29.01 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 807 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 621 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 452 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 1171 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 1560 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1088 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 534 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4175  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.13 
 
 		 1083 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 543 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 718 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.56 
 
 		 1348 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 634 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 352 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 490 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2315  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.11 
 
 		 458 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.13 
 
 		 740 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 		 951 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 668 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 884 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 713 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>