More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2752 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2907  hypothetical protein  69.78 
 
 		 327 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  66.06 
 
 		 323 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  63.89 
 
 		 325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3770  hypothetical protein  55.66 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4273  hypothetical protein  56 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  51.44 
 
 		 337 aa  348  9e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2406  hypothetical protein  50.93 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.58 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.68 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.34 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.64 
 
 		 339 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.14 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.48 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  41.09 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.76 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.98 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 		 314 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  45.12 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.14 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  44.11 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.77 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.57 
 
 		 328 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.61 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.05 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.75 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.38 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.41 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.75 
 
 		 328 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.6 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.25 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.3 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  41.06 
 
 		 312 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.42 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.42 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.32 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  40.27 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.27 
 
 		 337 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.2 
 
 		 327 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.37 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.05 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  38.77 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.08 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.88 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  44.03 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.01 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.88 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.24 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  41.43 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  38.89 
 
 		 336 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.2 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.56 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.5 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.73 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.52 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  42.14 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.87 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.98 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  39.2 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  38.39 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.23 
 
 		 328 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.6 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.5 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.2 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.8 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40.2 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.25 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  42.19 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.61 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  37.35 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  39.42 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  39.33 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  41.36 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  41.41 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.72 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.81 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.41 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.3 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.39 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.01 
 
 		 331 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.93 
 
 		 330 aa  246  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.93 
 
 		 330 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  40.2 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 329 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  34.77 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.28 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.69 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.74 
 
 		 698 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.4 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.96 
 
 		 333 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  39.27 
 
 		 334 aa  242  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  42.28 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  39.38 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>