More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1766 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 338 aa  668    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  46.2 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  42.38 
 
 		 329 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  42.68 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  43.6 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  46.1 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  44.71 
 
 		 331 aa  249  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  43.84 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  47.06 
 
 		 329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  43.2 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  40.06 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  44.55 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  40.66 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  37.41 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  37.54 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  37.01 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  38.13 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  35.64 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  33.99 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  35.42 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  34.15 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.59 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.72 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  34.95 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  36.45 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  34.09 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  37.11 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2282  hypothetical protein  32.1 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.736343  hitchhiker  0.00501521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  34.74 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  34.27 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  34.38 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  33.44 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  36.15 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  35.23 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  32.07 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  32.06 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  32.07 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  34.15 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  33.23 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  30.37 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3510  hypothetical protein  33.89 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  33.53 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  33.23 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  33.81 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  30.17 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  33.99 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  35.15 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  35.07 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3573  hypothetical protein  34.34 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.62 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  34.6 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  32.84 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  32.32 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3599  hypothetical protein  34.97 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373831  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  31.36 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  31.76 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  32.61 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  32.68 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2443  hypothetical protein  32.78 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.241679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3813  hypothetical protein  32.73 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  31.52 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  32.32 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  33.64 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1429  hypothetical protein  35.28 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  34.27 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  30.65 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  33.8 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  32.41 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  31.83 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  32.7 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  34.57 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  33.56 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  31.97 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  29.7 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  34.02 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  32.52 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  34.47 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  35.44 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  35.39 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  32.25 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  32.09 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  33.55 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  32.4 
 
 		 339 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  32.59 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  31.69 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  30.64 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  32.99 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  32.8 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  30.7 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.8 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1911  hypothetical protein  34.19 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248685  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  33.91 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  32.29 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  33.9 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.71 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>