More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1271 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  42.73 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 242 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 242 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 258 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  37.26 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  36.84 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 224 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 237 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 290 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>