More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2406 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2406  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  52.85 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  48.78 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  46.02 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5741  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621186  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 127 aa  103  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6494  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6166  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 212 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 212 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 212 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40.8 
 
 		 212 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 212 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 212 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 212 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 212 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.8 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40.8 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40.8 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40.8 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40.8 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.8 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40.8 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  47.57 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 214 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 214 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 214 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  38.98 
 
 		 210 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5188  response regulator receiver protein  45.56 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701464 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5182  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 256 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 211 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 211 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  37.7 
 
 		 210 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 215 aa  84  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1518  response regulator receiver protein  47.57 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  39.05 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 208 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5632  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.653856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  40.18 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2318  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.66 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 216 aa  77  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 209 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  42.2 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  37.14 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  35.4 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 247 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 210 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 208 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>