More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1868 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.68 
 
 		 547 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 539 aa  1078    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.0899176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2319  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  90.72 
 
 		 536 aa  927    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  50.28 
 
 		 582 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  50.09 
 
 		 591 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  47.86 
 
 		 563 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 854 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 430 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 651 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 444 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  38.32 
 
 		 1053 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  33.03 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 751 aa  160  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 583 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  34.89 
 
 		 796 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 632 aa  153  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 887 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 604 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  37.4 
 
 		 632 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 632 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 738 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 604 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 1267 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 627 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 524 aa  144  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 618 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 798 aa  143  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 504 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  34.11 
 
 		 533 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0806  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 865 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.613384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 355 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  35 
 
 		 749 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 704 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 810 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  34.16 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  32.27 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 761 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 1224 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 572 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 775 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 929 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 756 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 463 aa  136  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  34.71 
 
 		 526 aa  136  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1669 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 556 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 683 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 368 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  31.79 
 
 		 498 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 751 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  35.23 
 
 		 558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 930 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 1177 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  32.25 
 
 		 492 aa  134  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3631  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 361 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.991332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  31.29 
 
 		 505 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 749 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 799 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  35.77 
 
 		 755 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 639 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  32.89 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  33.57 
 
 		 727 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  37.41 
 
 		 584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 883 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 748 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  32.88 
 
 		 616 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 758 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  34.57 
 
 		 762 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 1166 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 575 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 394 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 904 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  34.49 
 
 		 579 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  33 
 
 		 538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  32.51 
 
 		 523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 1140 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 503 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 760 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 758 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 710 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>