More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7593 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7593  integrase family protein  100 
 
 		 331 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0713  phage integrase  57.83 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  56.46 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  56.46 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  56.46 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  56.46 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0667  integrase family protein  56.46 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2031  integrase family protein  56.46 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  40.06 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  40.06 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  40.06 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  40.06 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  41.21 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  41.03 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  37.31 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0245  integrase family protein  37.8 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  40.47 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  37.58 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  36.96 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  36.96 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  36.96 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  38.82 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  37.58 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  34.37 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  35.87 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0440  phage integrase  35.74 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  34.33 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  35.91 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  36.71 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  36.71 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  35.8 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  34.56 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  34.95 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  32.2 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8116  integrase/recombinase  29.94 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000851463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  28.87 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  30.29 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  32.42 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2216  integrase family protein  28.66 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000229864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.27 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  26.92 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.4 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.59 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.59 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  33.33 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  31.02 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  29 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  31.63 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  31.53 
 
 		 309 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  28.78 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  32.08 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  29.68 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8259  integrase/recombinase  36.36 
 
 		 246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  29.23 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.29 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.97 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.97 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.88 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.88 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.97 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  31.97 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.88 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.97 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.97 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  30.3 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  31.82 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.66 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.97 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  30.64 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  31.16 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  32.04 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  31.15 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  33.44 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.29 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.01 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  34 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.59 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  26.77 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  29.17 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>