195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5578 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  59.64 
 
 
275 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  59.64 
 
 
275 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  58.91 
 
 
275 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  58.33 
 
 
276 aa  325  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  56 
 
 
279 aa  308  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.01 
 
 
294 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
289 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  34.44 
 
 
300 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  32.85 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  32.12 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  35.19 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  34.43 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  37.36 
 
 
296 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  34.94 
 
 
310 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  34.94 
 
 
310 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  34.57 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  34.69 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  35.32 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  33.96 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  31.45 
 
 
320 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
290 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  37.28 
 
 
296 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
274 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  33.7 
 
 
327 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  33.7 
 
 
330 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  33.7 
 
 
330 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  33.7 
 
 
330 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  33.7 
 
 
324 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  33.7 
 
 
330 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  33.82 
 
 
368 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  33.33 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  33.33 
 
 
289 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  34.2 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  34.08 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  34.2 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  35.29 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  34.32 
 
 
286 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
297 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  31.77 
 
 
305 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  30.55 
 
 
323 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  29.6 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  30.43 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  32.47 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  34.69 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  29.24 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  33.09 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  34.17 
 
 
281 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
309 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  34.03 
 
 
295 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  34.07 
 
 
302 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  34.15 
 
 
296 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  33.8 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  33.8 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  33.8 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  33.8 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  30 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  29.63 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  29.24 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  32.13 
 
 
275 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.02 
 
 
280 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  32.73 
 
 
289 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
305 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  31.77 
 
 
289 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  31.48 
 
 
295 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  31.39 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  35.51 
 
 
282 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
277 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
272 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  32.34 
 
 
286 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  33.83 
 
 
293 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  33.83 
 
 
293 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  29.14 
 
 
302 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
302 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  31.36 
 
 
325 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
290 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  33.83 
 
 
293 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  29.52 
 
 
283 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  27.8 
 
 
304 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
314 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
312 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
304 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  30.66 
 
 
306 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  32.22 
 
 
303 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
282 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  32.22 
 
 
320 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
290 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  30.15 
 
 
321 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  31.39 
 
 
295 aa  99  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  30.86 
 
 
271 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  31.14 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  31.77 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  33.1 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  30.4 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  32.95 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>