More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4872 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4872  porin  100 
 
 		 386 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0644122  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  53.02 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  50.27 
 
 		 392 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0328  OmpC family outer membrane porin  46.58 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000489556  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  40.25 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  40 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  42.04 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  40.62 
 
 		 374 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  40.4 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  40.4 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  40.4 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.6 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  40.15 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  40.15 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.35 
 
 		 385 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.14 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  38.7 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.7 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  40.3 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  39.32 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  39.4 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40.05 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  38.37 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  39.29 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.6 
 
 		 436 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  37.85 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.04 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.56 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.04 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.6 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.6 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.6 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.6 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  38.54 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.6 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.6 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  39.9 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  37.78 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  41.31 
 
 		 380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  40.96 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  40.69 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  39.21 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.52 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.35 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  38.24 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.41 
 
 		 375 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  41.27 
 
 		 380 aa  215  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  41.02 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  38.71 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  40.24 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.53 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  41.87 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.53 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  39.46 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  39.62 
 
 		 366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  39.62 
 
 		 366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  39.66 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  39.66 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  39.66 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  38.81 
 
 		 387 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  40.48 
 
 		 380 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  38.64 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  37.02 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  38.32 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  37.66 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  41.87 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  38.75 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  40.58 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  40.31 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  40.31 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  40.05 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  40.31 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  40.31 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  40.31 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.26 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  37.81 
 
 		 358 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  37.87 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  38.9 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  37.6 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  36.83 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  37.97 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  38.79 
 
 		 383 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  38.04 
 
 		 409 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  36.5 
 
 		 384 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  36.88 
 
 		 384 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  35.21 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  34.95 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  36.76 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  37.13 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  36.17 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  38.81 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.67 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  37.13 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  37.13 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  36.57 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  36.32 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  36.9 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  36.06 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  36.06 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  36.32 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>