More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4403 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  81.82 
 
 
233 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  82.25 
 
 
233 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  68.24 
 
 
233 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  68.24 
 
 
233 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  68.24 
 
 
233 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  68.24 
 
 
233 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  68.1 
 
 
247 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  69.4 
 
 
233 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  68.1 
 
 
247 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  69.4 
 
 
233 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  69.74 
 
 
233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  69.74 
 
 
233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  69.74 
 
 
233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  69.74 
 
 
233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  69.74 
 
 
233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  69.74 
 
 
233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  69.74 
 
 
233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  59.82 
 
 
240 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  57.99 
 
 
244 aa  268  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  60.73 
 
 
245 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 
261 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  60.56 
 
 
247 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  60.56 
 
 
247 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  57.01 
 
 
222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  47.56 
 
 
239 aa  224  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  48.46 
 
 
260 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  48.54 
 
 
253 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 
366 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 
263 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  48.66 
 
 
264 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  46.22 
 
 
259 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  42.49 
 
 
380 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
385 aa  188  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  42.24 
 
 
380 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  41.2 
 
 
380 aa  181  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  47.89 
 
 
219 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  46.46 
 
 
213 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  43.84 
 
 
602 aa  171  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
368 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  38.43 
 
 
342 aa  167  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 
359 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  39.27 
 
 
391 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  40.62 
 
 
371 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0330  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  38.64 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  38.1 
 
 
309 aa  163  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
355 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  42.04 
 
 
370 aa  161  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
352 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  40.93 
 
 
352 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
357 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  40.37 
 
 
362 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03870  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  42.41 
 
 
370 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  42.29 
 
 
374 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 
372 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.07 
 
 
604 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  40.93 
 
 
352 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.47 
 
 
350 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 
355 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2611  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
351 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  35.93 
 
 
290 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  43.81 
 
 
352 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.33 
 
 
358 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.57 
 
 
604 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
353 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  43.06 
 
 
241 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
326 aa  156  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 
370 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  41.82 
 
 
367 aa  156  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  42.36 
 
 
347 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 
372 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  38.31 
 
 
329 aa  155  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  36.7 
 
 
361 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  41.28 
 
 
243 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  44.06 
 
 
357 aa  155  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  42.44 
 
 
398 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  37.18 
 
 
289 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
405 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
628 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  41.87 
 
 
350 aa  155  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2960  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein modC  44 
 
 
345 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  37.38 
 
 
323 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  41.87 
 
 
368 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  41.87 
 
 
330 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  39.91 
 
 
356 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  42.57 
 
 
363 aa  154  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 
368 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
294 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1074  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  42.65 
 
 
269 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278365  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  44.91 
 
 
601 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4452  ABC transporter related  43.59 
 
 
380 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  42.79 
 
 
356 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
296 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.98 
 
 
368 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1387  sulphate transport system permease protein 1  43.69 
 
 
240 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  37.56 
 
 
339 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  42.92 
 
 
385 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  43.33 
 
 
357 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>