More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4319 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  48.98 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  61.95 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  47.34 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  61.06 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  61.06 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  61.82 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  61.82 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  61.82 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  61.82 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  61.82 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  50.34 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  43.5 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  44.92 
 
 		 342 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  41.35 
 
 		 342 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  66.32 
 
 		 227 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  58.88 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  44.92 
 
 		 341 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  40.87 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  51.85 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  67.68 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  41.27 
 
 		 270 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.94 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  60 
 
 		 297 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  40.51 
 
 		 333 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  40 
 
 		 332 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  51.11 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 203 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  40 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  40 
 
 		 333 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  61 
 
 		 175 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  62.38 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  65.26 
 
 		 381 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 285 aa  131  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  50.76 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  38.97 
 
 		 333 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  41.28 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 335 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  45.73 
 
 		 360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  45.73 
 
 		 360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  61.17 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 409 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  64.21 
 
 		 391 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  64.58 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  55.96 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  57.69 
 
 		 263 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  60.4 
 
 		 324 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  39.47 
 
 		 297 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  56.57 
 
 		 337 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 321 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  34.63 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  37.95 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  47.86 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  60.61 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 324 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  63.16 
 
 		 331 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  53 
 
 		 269 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  46.04 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  46.43 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  61.7 
 
 		 342 aa  124  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  57.8 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  67.74 
 
 		 121 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  46.03 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  45.8 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  55.86 
 
 		 121 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  41.11 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  49.63 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  64.52 
 
 		 121 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 262 aa  121  8e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  38.17 
 
 		 163 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  58.59 
 
 		 303 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  46.62 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  46.53 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  58.59 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 171 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 283 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  66.3 
 
 		 94 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  59.78 
 
 		 358 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>