More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0212 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0212  hydrolase, TatD family  100 
 
 
270 aa  553  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.02285e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  37.12 
 
 
260 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  40.15 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  36.74 
 
 
260 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  35.63 
 
 
258 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.32 
 
 
464 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  34.46 
 
 
267 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.21 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.58 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  33.58 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.58 
 
 
458 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  35.19 
 
 
255 aa  162  7e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  35.5 
 
 
263 aa  161  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  35.98 
 
 
257 aa  160  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  35.85 
 
 
259 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  36.15 
 
 
273 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  32.7 
 
 
269 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  33.21 
 
 
261 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  35.79 
 
 
454 aa  156  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  37.5 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  36.98 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 
256 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  37.12 
 
 
263 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  32.83 
 
 
261 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.58 
 
 
256 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  33.84 
 
 
262 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  34.24 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  32.45 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  34.24 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  34.98 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  32.95 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  32.71 
 
 
260 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.52 
 
 
256 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  32.33 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  34.22 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  32.33 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 
256 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  32.71 
 
 
260 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  32.96 
 
 
257 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  32.45 
 
 
261 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  32.82 
 
 
273 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  33.33 
 
 
260 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  35.66 
 
 
267 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  34.94 
 
 
264 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  32.83 
 
 
278 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  32.45 
 
 
273 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  35.71 
 
 
264 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  32.83 
 
 
270 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  32.33 
 
 
262 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 
253 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  33.21 
 
 
255 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  32.7 
 
 
271 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  33.58 
 
 
285 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  31.3 
 
 
256 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  35.56 
 
 
256 aa  148  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  32.58 
 
 
259 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  35.27 
 
 
263 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  32.45 
 
 
261 aa  148  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  33.08 
 
 
262 aa  148  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  32.83 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  32.43 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  31.68 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1195  hydrolase, TatD family  32.71 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  32.58 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  30.83 
 
 
462 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  31.68 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  32.57 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  32.58 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  39.71 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  32.28 
 
 
462 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  33.09 
 
 
263 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  33.74 
 
 
276 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  34.68 
 
 
263 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  31.06 
 
 
459 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  34.69 
 
 
265 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  31.72 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  32.31 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  31.46 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  33.58 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  31.52 
 
 
276 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  32.82 
 
 
270 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  32.24 
 
 
258 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  31.72 
 
 
258 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  31.44 
 
 
257 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  32.2 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  32.7 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  32.56 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  32.58 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32.58 
 
 
255 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  31.66 
 
 
262 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  30.77 
 
 
265 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  32.93 
 
 
269 aa  144  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  32.41 
 
 
280 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  32.82 
 
 
268 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  30.04 
 
 
263 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  31.84 
 
 
261 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  34.11 
 
 
263 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  31.18 
 
 
263 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  33.71 
 
 
253 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  31.01 
 
 
255 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>