More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1797 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  69.48 
 
 		 445 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  71.16 
 
 		 441 aa  638    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  77.63 
 
 		 438 aa  722    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  71.53 
 
 		 444 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  82.84 
 
 		 440 aa  753    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  76.2 
 
 		 439 aa  703    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  71.4 
 
 		 441 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  71.53 
 
 		 443 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 439 aa  664    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  76.94 
 
 		 439 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  76.99 
 
 		 439 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  76.03 
 
 		 439 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  76.66 
 
 		 439 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  77.35 
 
 		 444 aa  713    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 439 aa  892    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 441 aa  627  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 		 442 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  65.75 
 
 		 444 aa  621  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  71.16 
 
 		 441 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  65.99 
 
 		 442 aa  614  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 		 435 aa  616  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  67.43 
 
 		 440 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  66.36 
 
 		 440 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  65.91 
 
 		 440 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  63.64 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  65.38 
 
 		 498 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 450 aa  588  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 445 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 445 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 445 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 445 aa  559  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  61.42 
 
 		 437 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 451 aa  544  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 		 452 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  61 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 424 aa  418  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 435 aa  318  9e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 568 aa  299  8e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 573 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 585 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 573 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 570 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 581 aa  292  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 570 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 581 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 569 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 580 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 573 aa  286  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 566 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 564 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 570 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 573 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 580 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  57.33 
 
 		 571 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 576 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 580 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 571 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 578 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 574 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 569 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 576 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 578 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 584 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0745  prolyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 581 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 582 aa  283  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 571 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 		 573 aa  282  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 571 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 574 aa  282  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 570 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 578 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 578 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 570 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 568 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 578 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 570 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 572 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 570 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 570 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>