More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3343 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  73.33 
 
 		 437 aa  667    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 438 aa  891    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  64.63 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 		 440 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 437 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 439 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  64.93 
 
 		 439 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  64.84 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 		 442 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  64.17 
 
 		 443 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 441 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 		 444 aa  554  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  63.95 
 
 		 444 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 441 aa  557  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  63.8 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 440 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  63.43 
 
 		 439 aa  551  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  62.53 
 
 		 439 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 440 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 442 aa  545  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  62.27 
 
 		 498 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 		 442 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  61.84 
 
 		 442 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  61.84 
 
 		 442 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 445 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 441 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  60.23 
 
 		 440 aa  535  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 450 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  61 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 451 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 452 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 441 aa  519  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 422 aa  464  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 576 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 568 aa  277  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 571 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 571 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  59.19 
 
 		 575 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 571 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 571 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 570 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 570 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 571 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 585 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 573 aa  273  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 573 aa  272  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 569 aa  272  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 571 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 571 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 579 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 569 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 		 571 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 569 aa  270  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 570 aa  270  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02965  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 572 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 571 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 574 aa  269  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 571 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0751  prolyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 576 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 574 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 		 570 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 573 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 581 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 571 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 571 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 566 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 574 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 564 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 580 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 571 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 570 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 567 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 570 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 578 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>