More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4144 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  72.05 
 
 		 498 aa  670    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  69.46 
 
 		 444 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 439 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  71.36 
 
 		 442 aa  651    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 		 438 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  81.55 
 
 		 441 aa  737    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  71.53 
 
 		 439 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  71.59 
 
 		 442 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  70.78 
 
 		 440 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  71.07 
 
 		 439 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  84.28 
 
 		 441 aa  778    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  80.64 
 
 		 441 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  70.39 
 
 		 439 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  70.16 
 
 		 439 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  70.39 
 
 		 439 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  71.3 
 
 		 439 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  71.95 
 
 		 442 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  76.77 
 
 		 440 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  72.15 
 
 		 442 aa  671    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  70.84 
 
 		 440 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  94.53 
 
 		 444 aa  849    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  71.13 
 
 		 442 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  80.41 
 
 		 441 aa  749    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  71 
 
 		 440 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 443 aa  901    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 435 aa  634  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  69.95 
 
 		 445 aa  625  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  69 
 
 		 444 aa  626  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 441 aa  619  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  64.46 
 
 		 450 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 437 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 445 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 		 445 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 445 aa  589  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 445 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  61.56 
 
 		 451 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 437 aa  564  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  64.17 
 
 		 438 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 452 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 573 aa  296  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 573 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 585 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 566 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 568 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 564 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 571 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 576 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 570 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 		 573 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 569 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02965  prolyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 572 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 571 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 574 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 580 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 571 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 		 574 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 571 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 572 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 572 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 572 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 572 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 571 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 572 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 571 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 570 aa  280  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 574 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 571 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 578 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 572 aa  279  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 571 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 578 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 569 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 584 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 578 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 581 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 578 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 570 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 570 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 569 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 571 aa  276  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 571 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 578 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>