More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3276 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 441 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  77.63 
 
 		 439 aa  722    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  86.5 
 
 		 444 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 438 aa  899    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  71.75 
 
 		 440 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 441 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  86.96 
 
 		 439 aa  792    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  69.18 
 
 		 439 aa  658    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  93.84 
 
 		 439 aa  857    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  73.91 
 
 		 440 aa  691    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  88.13 
 
 		 439 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  93.61 
 
 		 439 aa  849    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  87.87 
 
 		 439 aa  799    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 445 aa  655    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 		 443 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  70.39 
 
 		 444 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 		 444 aa  644    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  68.56 
 
 		 441 aa  634  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  67.65 
 
 		 442 aa  626  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  67.73 
 
 		 435 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  65 
 
 		 442 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 441 aa  616  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  65 
 
 		 440 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 		 450 aa  612  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  66.29 
 
 		 445 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  66.29 
 
 		 445 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 440 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  66.06 
 
 		 445 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 442 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  65 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 442 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 		 498 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 445 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 437 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 441 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 		 451 aa  568  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 437 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  61.5 
 
 		 452 aa  551  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 585 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 573 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 566 aa  292  8e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 568 aa  292  8e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 570 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 564 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 578 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 574 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 569 aa  289  6e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 576 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 573 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 571 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 571 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 578 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 578 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 578 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 578 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 578 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 578 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 571 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02965  prolyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 570 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 570 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 581 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 578 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 580 aa  286  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 571 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 571 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 569 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 569 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 571 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 571 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 578 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 572 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 573 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 571 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 572 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 576 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 570 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 580 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 570 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>