More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0740 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  87.5 
 
 		 424 aa  791    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  877    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 422 aa  588  1e-167  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 439 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 444 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 		 564 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 566 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 576 aa  292  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 574 aa  292  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 574 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 570 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 580 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02965  prolyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 572 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 572 aa  288  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 573 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 569 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 574 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 571 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  57.85 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 573 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 570 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 571 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 569 aa  286  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 571 aa  286  7e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 		 571 aa  286  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 576 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 585 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 		 572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 		 572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 571 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 579 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 571 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 571 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 571 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 571 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>