More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2597 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 441 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 441 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  70.78 
 
 		 445 aa  658    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  72.21 
 
 		 440 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  86.3 
 
 		 444 aa  794    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  76.94 
 
 		 439 aa  721    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  70.39 
 
 		 443 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  86.5 
 
 		 439 aa  791    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  68.95 
 
 		 439 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 439 aa  902    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  89.95 
 
 		 439 aa  820    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  93.84 
 
 		 438 aa  857    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  96.58 
 
 		 439 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  88.1 
 
 		 439 aa  801    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 441 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  76.2 
 
 		 440 aa  709    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  69.7 
 
 		 444 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  70.32 
 
 		 444 aa  644    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  67.5 
 
 		 442 aa  627  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 		 442 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 		 435 aa  619  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 441 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  64.92 
 
 		 440 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  66.06 
 
 		 450 aa  614  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 445 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 445 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 		 440 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  65.45 
 
 		 445 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 442 aa  601  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 498 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 442 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  65 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 445 aa  589  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 441 aa  585  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  65.38 
 
 		 437 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 		 451 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  62.19 
 
 		 437 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 		 452 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 585 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 573 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 581 aa  293  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 570 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 568 aa  293  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 573 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  60.35 
 
 		 576 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 571 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 569 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 571 aa  289  6e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 		 564 aa  289  7e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 		 566 aa  289  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 570 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 570 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 		 576 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 578 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 569 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 571 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 571 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 573 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 571 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 578 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 578 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 578 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 578 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 578 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 580 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 571 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 569 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 574 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02965  prolyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 584 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 576 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 578 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 570 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 570 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 579 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 574 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 571 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>