More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0160 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  100 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  75.78 
 
 		 224 aa  343  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  74.44 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  74.55 
 
 		 224 aa  338  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  75 
 
 		 225 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  73.99 
 
 		 224 aa  334  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  73.99 
 
 		 224 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  73.54 
 
 		 224 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  72.77 
 
 		 224 aa  331  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  73.09 
 
 		 224 aa  330  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  73.09 
 
 		 224 aa  330  8e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  72.65 
 
 		 224 aa  329  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  72.65 
 
 		 224 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  76.34 
 
 		 224 aa  322  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  76.34 
 
 		 224 aa  321  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  76.79 
 
 		 224 aa  321  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  69.06 
 
 		 224 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  68.35 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  65.61 
 
 		 233 aa  298  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  61.88 
 
 		 224 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  61.43 
 
 		 327 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  62.1 
 
 		 228 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  41.96 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  39.63 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  41.94 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  36.74 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  36.74 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  36.74 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.68 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.18 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.7 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  37.09 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.22 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.6 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.53 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  34.27 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.64 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.45 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.09 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.05 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  30.14 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  32.57 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  36.22 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.24 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  30.18 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  34.05 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  35.33 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.72 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.89 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.16 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.48 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.08 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.44 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.94 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 396 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  27.23 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  32.58 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.96 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  34.59 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  34.59 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  34.59 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  34.59 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.61 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  34.59 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0904  HAD family hydrolase  29.9 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1427  HAD family hydrolase  30.32 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.828576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  30.06 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  35.03 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  36.22 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  32.14 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  36.22 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  34.05 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  36.22 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  29.03 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.98 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  32.76 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  28.35 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.4 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.41 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.9 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>