273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  100 
 
 		 587 aa  1160    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  58.06 
 
 		 556 aa  615  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  58.14 
 
 		 554 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  27.4 
 
 		 474 aa  134  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  26.27 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  24.25 
 
 		 674 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  24.83 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  24.36 
 
 		 699 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  24.66 
 
 		 704 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  25 
 
 		 507 aa  88.6  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  27.7 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  23.53 
 
 		 709 aa  86.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  25.95 
 
 		 643 aa  85.9  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  23.44 
 
 		 659 aa  85.9  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  22.1 
 
 		 668 aa  85.9  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  23.02 
 
 		 679 aa  85.9  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  25.84 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  26.4 
 
 		 724 aa  84.7  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  25.06 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  23.34 
 
 		 668 aa  83.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  22.52 
 
 		 692 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.56 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  24.89 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.4 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  26.11 
 
 		 680 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  21.78 
 
 		 658 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  25.87 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  25.41 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  26.71 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  25.97 
 
 		 693 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.12 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.94 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  24.57 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  24.51 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.12 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  24.57 
 
 		 483 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  24.57 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.44 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.12 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  25.23 
 
 		 483 aa  72  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  25 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  25.87 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  25.66 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  25.87 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  25.06 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  25.06 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  25.06 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  25.66 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  25.23 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  25.23 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  25.23 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  25.23 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  25.23 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  25.23 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  25.23 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  25.64 
 
 		 483 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  22.35 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.63 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  24.43 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.7 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.9 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.89 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  22.04 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.89 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  25.38 
 
 		 551 aa  67  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.89 
 
 		 463 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 513 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25.34 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  25.38 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  25.38 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.49 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  25.6 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  22.88 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  23.01 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  20.93 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.67 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.67 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.67 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  25.24 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25.97 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  25 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.67 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.67 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.8 
 
 		 483 aa  63.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  19.59 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  25.42 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.94 
 
 		 526 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  24.29 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.36 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.88 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.26 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  24.12 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.02 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  30.11 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  24.15 
 
 		 552 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  23.48 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>