296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7360 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  100 
 
 
203 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  85.71 
 
 
203 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  84.24 
 
 
203 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  74.38 
 
 
202 aa  264  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  64.53 
 
 
202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  64.53 
 
 
202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  45.85 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  47.87 
 
 
222 aa  138  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  50.56 
 
 
215 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  47.9 
 
 
232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  49.39 
 
 
202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  46.96 
 
 
202 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  45.95 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  45.95 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  42.72 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  47.06 
 
 
237 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  38.46 
 
 
267 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  38.19 
 
 
233 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  33.17 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  31.29 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  31.05 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  31.48 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  32.94 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  38.78 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  37.25 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  36.27 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  28.4 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  30.43 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  28.4 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  28.4 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  28.4 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.28 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  27.78 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  34.62 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  34.31 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  29.19 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  32.31 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  30.37 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  30.99 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  32.76 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  33.01 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  36.36 
 
 
743 aa  61.6  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  30 
 
 
215 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
212 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  26.81 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  32.56 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  32.69 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  36.56 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  25 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28.15 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  29.37 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  33.65 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  31.86 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  26.7 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  28.98 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  27.75 
 
 
239 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  26.85 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  27.52 
 
 
220 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  26.54 
 
 
187 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.39 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  27.86 
 
 
283 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  31.01 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  22.8 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  28.03 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  29.13 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  30.66 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  30.92 
 
 
211 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  26.7 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  34.38 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  33.66 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  34.04 
 
 
195 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  26.13 
 
 
198 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  26.13 
 
 
198 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  29.41 
 
 
962 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  29.17 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  29.21 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  27.27 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  29.41 
 
 
974 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  27.27 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  21.29 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  27.74 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  29.41 
 
 
950 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  29.37 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  27.84 
 
 
229 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  29.37 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  30.89 
 
 
204 aa  52  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2774  ubiquinol oxidase, subunit III  32.28 
 
 
201 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  25.7 
 
 
204 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  34.15 
 
 
285 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  26.13 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  33 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2716  ubiquinol oxidase, subunit III  31.75 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.089432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  32.17 
 
 
285 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>