92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4831 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
178 aa  354  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  36.02 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  30.54 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0090  MarR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0236682  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
177 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4672  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0948  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3286  transcriptional regulator, MarR family  33.14 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000146824  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  41.75 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  31.09 
 
 
261 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
146 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
138 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.09 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
169 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.69 
 
 
158 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
189 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.79 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.85 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.85 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.07 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  23.47 
 
 
139 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
188 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  23.47 
 
 
139 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
131 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
131 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
131 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
160 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
131 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
131 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
156 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
152 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
157 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
153 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  27.03 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
142 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
680 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 
191 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 
139 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
164 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
157 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
160 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  30.19 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>