More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3702 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 260 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  96.54 
 
 		 260 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  95.38 
 
 		 260 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  95.38 
 
 		 260 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  92.66 
 
 		 259 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  92.69 
 
 		 260 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  90.38 
 
 		 260 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  82.24 
 
 		 259 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  81.85 
 
 		 269 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  82.24 
 
 		 259 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  82.24 
 
 		 259 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  82.24 
 
 		 259 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  81.47 
 
 		 269 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  81.85 
 
 		 259 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  79.15 
 
 		 269 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  78.76 
 
 		 258 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  78.38 
 
 		 258 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  78.38 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  54.05 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  53.67 
 
 		 259 aa  288  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  57.14 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  58.14 
 
 		 265 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  55.98 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  54.79 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.8 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.8 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 		 248 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.08 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.08 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  43.53 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.48 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.32 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.01 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.84 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.3 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0429275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.27 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6276  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.15 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.22175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.3 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.5 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.04 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.06 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.3 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 248 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.39 
 
 		 252 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 		 247 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>