More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6301 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  81.26 
 
 		 467 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  88.81 
 
 		 469 aa  827    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  85.68 
 
 		 469 aa  830    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  81.05 
 
 		 467 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  80.89 
 
 		 479 aa  759    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  76.31 
 
 		 486 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  78.28 
 
 		 479 aa  771    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  81.84 
 
 		 472 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  86.49 
 
 		 477 aa  837    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 468 aa  956    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  81.26 
 
 		 467 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  90.17 
 
 		 469 aa  877    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  80.74 
 
 		 474 aa  763    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  81.26 
 
 		 467 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  81.26 
 
 		 467 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  78.21 
 
 		 474 aa  745    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  82.65 
 
 		 476 aa  796    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  85.47 
 
 		 469 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  79.57 
 
 		 469 aa  777    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  80.22 
 
 		 479 aa  756    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  78.76 
 
 		 471 aa  750    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  88.29 
 
 		 469 aa  845    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  58.26 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  58.13 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  56.16 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  57.52 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  48.7 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  44.01 
 
 		 477 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  41.83 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  39.69 
 
 		 432 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  37.17 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.42 
 
 		 488 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  34.99 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  34.73 
 
 		 482 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  36.72 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  30.69 
 
 		 508 aa  196  7e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  33.2 
 
 		 493 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  33.74 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  32.58 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  32.59 
 
 		 503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.9 
 
 		 488 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.81 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.58 
 
 		 597 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.12 
 
 		 493 aa  99.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.51 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.74 
 
 		 588 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.95 
 
 		 502 aa  99  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.89 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.72 
 
 		 591 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.37 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  26.92 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  26.18 
 
 		 519 aa  91.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  25.6 
 
 		 519 aa  90.5  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  27.72 
 
 		 591 aa  90.1  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.04 
 
 		 589 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.95 
 
 		 589 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  21.89 
 
 		 507 aa  86.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.81 
 
 		 491 aa  86.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.79 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.45 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.2 
 
 		 598 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 507 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  25.92 
 
 		 517 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  26.86 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.59 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  25.7 
 
 		 517 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25 
 
 		 598 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.85 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  26.65 
 
 		 596 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  24.44 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  28.1 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.63 
 
 		 589 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  25.47 
 
 		 631 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.56 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 515 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.29 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.79 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.93 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  26.28 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  27.89 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.97 
 
 		 596 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.74 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.12 
 
 		 564 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  24.54 
 
 		 925 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 517 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  23.53 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  27.39 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  27.39 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  27.67 
 
 		 658 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.56 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  23.85 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  27.56 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  24.74 
 
 		 608 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.52 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.88 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  29.19 
 
 		 578 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  26.35 
 
 		 597 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.9 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  25.41 
 
 		 596 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>