More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3634 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  72.81 
 
 		 229 aa  339  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 		 229 aa  316  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.95 
 
 		 228 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 		 229 aa  257  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  61.14 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  55.17 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.9 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  54.63 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  54.35 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.56 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  54.63 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 		 249 aa  242  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 342 aa  242  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.85 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  46.09 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  43.75 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 154 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.1 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  44.64 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.09 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.25 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  40.61 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.78 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  44.84 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.48 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.17 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4448  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  39.65 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.65 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.65 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.65 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.65 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.65 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.65 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.65 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  43.75 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  43.75 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.86 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>