209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0843 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0843  Zinc finger, CHC2-type  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1324  zinc finger, CHC2-family protein  100 
 
 		 119 aa  228  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0303818  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  36.56 
 
 		 639 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.84 
 
 		 583 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.84 
 
 		 582 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  41.94 
 
 		 629 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.84 
 
 		 598 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  47.27 
 
 		 625 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.53 
 
 		 571 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.53 
 
 		 600 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  37.1 
 
 		 634 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  38.6 
 
 		 637 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.84 
 
 		 587 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  38.98 
 
 		 658 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  38.71 
 
 		 652 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  35.06 
 
 		 616 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  41.94 
 
 		 588 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  36.36 
 
 		 645 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  42.19 
 
 		 588 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  35.48 
 
 		 656 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  39.13 
 
 		 616 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.34 
 
 		 598 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  47.06 
 
 		 573 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  39.34 
 
 		 587 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  35.06 
 
 		 623 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  32.65 
 
 		 576 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1138  DNA primase  38.46 
 
 		 454 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  32.22 
 
 		 625 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  38.71 
 
 		 587 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  41.18 
 
 		 623 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  33.67 
 
 		 552 aa  47.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  32.35 
 
 		 639 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  37.1 
 
 		 718 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  35.06 
 
 		 656 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  34.62 
 
 		 655 aa  47  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  40.32 
 
 		 583 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  43.14 
 
 		 621 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  38.81 
 
 		 599 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  37.93 
 
 		 600 aa  46.6  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  34.94 
 
 		 629 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  40 
 
 		 582 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  37.1 
 
 		 642 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  34.85 
 
 		 605 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  40 
 
 		 576 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0641  DNA primase  45.1 
 
 		 572 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  43.14 
 
 		 567 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  35.48 
 
 		 651 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  35.44 
 
 		 605 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf347  DNA primase  40 
 
 		 612 aa  46.6  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.603388  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  34.85 
 
 		 614 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  39.68 
 
 		 627 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  32.53 
 
 		 572 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  39.34 
 
 		 632 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  36.07 
 
 		 588 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  37.66 
 
 		 631 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  36.07 
 
 		 590 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  36.07 
 
 		 590 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  37.25 
 
 		 578 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.6 
 
 		 601 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  34.09 
 
 		 452 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  30.67 
 
 		 535 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  33.85 
 
 		 599 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 604 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.48 
 
 		 601 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  29.47 
 
 		 581 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  29.47 
 
 		 581 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  29.47 
 
 		 581 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  33.87 
 
 		 699 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  29.47 
 
 		 581 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  32.26 
 
 		 641 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  41.38 
 
 		 572 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  43.64 
 
 		 407 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  29.47 
 
 		 581 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  31.73 
 
 		 655 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  33.33 
 
 		 640 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.67 
 
 		 595 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.67 
 
 		 595 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  39.22 
 
 		 618 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  43.64 
 
 		 646 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4594  DNA primase  33.33 
 
 		 632 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35.94 
 
 		 614 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  35.21 
 
 		 544 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  31.73 
 
 		 681 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  30.77 
 
 		 571 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  36.21 
 
 		 580 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  35 
 
 		 550 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42826  predicted protein  38.33 
 
 		 1192 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  35.16 
 
 		 664 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  41.18 
 
 		 588 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  33.71 
 
 		 671 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.16 
 
 		 663 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  31.91 
 
 		 669 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>