243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3645 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  79.88 
 
 		 189 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  55.25 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  59.76 
 
 		 195 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  51.65 
 
 		 183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  50.87 
 
 		 184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  51.1 
 
 		 183 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  52.07 
 
 		 184 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  52.98 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  55.03 
 
 		 185 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  45.95 
 
 		 183 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  50 
 
 		 192 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  50.29 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  55.63 
 
 		 184 aa  171  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  49.73 
 
 		 182 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  49.18 
 
 		 185 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  47.85 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  48.63 
 
 		 186 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  48.11 
 
 		 183 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  45.6 
 
 		 183 aa  165  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  47.34 
 
 		 188 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  49.71 
 
 		 192 aa  165  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  49.71 
 
 		 181 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  50.61 
 
 		 183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  47.09 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  46.84 
 
 		 186 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  47.03 
 
 		 183 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  48.62 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  45.6 
 
 		 184 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  48.62 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  41.99 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  47.95 
 
 		 188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  50.91 
 
 		 186 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  45.2 
 
 		 185 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  46.67 
 
 		 199 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  44.51 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  44.51 
 
 		 180 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  44.51 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  43.11 
 
 		 189 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  45.78 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  50 
 
 		 195 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  42.94 
 
 		 189 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  48.57 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  43.78 
 
 		 201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  46.11 
 
 		 182 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  50.99 
 
 		 208 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  48 
 
 		 196 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  50.99 
 
 		 187 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  45.18 
 
 		 180 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  41.71 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  43.98 
 
 		 180 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  44.71 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  43.65 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  39.8 
 
 		 195 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  42.63 
 
 		 193 aa  141  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  42.22 
 
 		 196 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  38.89 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  44.81 
 
 		 196 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  43.2 
 
 		 185 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  39.36 
 
 		 187 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  39.7 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  46.34 
 
 		 180 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  46.11 
 
 		 189 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  42.44 
 
 		 185 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  40.84 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  39.59 
 
 		 197 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  41.53 
 
 		 196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  47.37 
 
 		 186 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  41.52 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  44.57 
 
 		 194 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  39.18 
 
 		 193 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  43.53 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  43.45 
 
 		 197 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  40.11 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  39.88 
 
 		 187 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  37.3 
 
 		 189 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  41.01 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  40.25 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  40.35 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  44.44 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  38.28 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  43.43 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  39.9 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  40.59 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  41.14 
 
 		 198 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  40.61 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  36.7 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  38.62 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  39.79 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  38.62 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  41.1 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  33.54 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  39.02 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  39.01 
 
 		 190 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  39.2 
 
 		 208 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  38.75 
 
 		 190 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  39.2 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  35.68 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  37.93 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  39.2 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>