222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2345 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  100 
 
 		 268 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  54.1 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  52.63 
 
 		 294 aa  258  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  49.81 
 
 		 278 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  44.98 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  46.82 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  51.69 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  47.01 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  45.15 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  47.94 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  47.19 
 
 		 274 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  45.14 
 
 		 285 aa  225  6e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  47.39 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.25 
 
 		 276 aa  221  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  39.03 
 
 		 276 aa  219  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  41.85 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  51.12 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  51.12 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  41.51 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  46.89 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  40.21 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  42.24 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  39.49 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  40.43 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  39.93 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  48.36 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  38.35 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  40.39 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  35.91 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  34.38 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  33.82 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  33.82 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.22 
 
 		 434 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  33.45 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  31.78 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  33.09 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  31.05 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  38.52 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  29.63 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.73 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  33.22 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  27.9 
 
 		 351 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  31.1 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  28.95 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  34.44 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25.48 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  31.71 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.46 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  27.05 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  32.55 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.04 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  31.52 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  30.36 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  33.85 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.77 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  31.25 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  30.34 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.45 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.54 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  29.89 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  35.05 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1880  hypothetical protein  29.52 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.42 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  29.7 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  29.75 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  34.09 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  28.72 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.01 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  27.24 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.94 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  30.22 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  31.18 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  29.74 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  28.72 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  30.47 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  29.2 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  33.7 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  32.56 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6771  NmrA-like protein  50.75 
 
 		 81 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  30.77 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  29.28 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  28.87 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.21 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  31.82 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  29.2 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  32.9 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  24.11 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  28.36 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  27.4 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  33.08 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  26.26 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  31.45 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  31.09 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  28.69 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  27.01 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  28.63 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  31.56 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6338  predicted protein  26.07 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>