147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2018 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 217 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  51.08 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  44.78 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  50.71 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  47.59 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  45.57 
 
 		 186 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  47.52 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  42.05 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  43.31 
 
 		 268 aa  88.6  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  40.67 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  47.93 
 
 		 254 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  36.91 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  38.69 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  31.52 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  47.95 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  33.11 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  44.19 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  34.81 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  38.64 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  30.19 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  30.82 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4026  peptidase A24A prepilin type IV  44.78 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369556  hitchhiker  0.00138175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  45.9 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  26.29 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  30.67 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  34.69 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  45.65 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  28.25 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  32.43 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  32.43 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  31.82 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  31.15 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  25.75 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  31.25 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  41.8 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  32.32 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  30.56 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.47 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  27.53 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  27.51 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  28.89 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  24.57 
 
 		 303 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  32.89 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  35.94 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  24.86 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  22.53 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  22.16 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  22.16 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  29.68 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  22.16 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  28.47 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  30.99 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  26.32 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  25.7 
 
 		 305 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  25.27 
 
 		 304 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.99 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  41.67 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.47 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  27.66 
 
 		 302 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  31.71 
 
 		 303 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.29 
 
 		 283 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  34.88 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.7 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.23 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  37.88 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.76 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  20.88 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  31.62 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.25 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  37.82 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  29.17 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  29.79 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  31.94 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.99 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  32.32 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  27.23 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  23.83 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  28.18 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  29.27 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  26.29 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  30 
 
 		 283 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  29.65 
 
 		 290 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.55 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.7 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.7 
 
 		 309 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  26.42 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  28.57 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  24.29 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  37.36 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  24.08 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.46 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  38.46 
 
 		 303 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  32.04 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  38.46 
 
 		 303 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3440  prepilin peptidase  30.12 
 
 		 303 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.823823  normal  0.0376305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  38.46 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  28.21 
 
 		 293 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  28.36 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1357  late competence protein comC  25 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>