More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1444 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.56 
 
 		 873 aa  930    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.29 
 
 		 869 aa  781    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.23 
 
 		 847 aa  905    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  57.01 
 
 		 838 aa  895    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.53 
 
 		 827 aa  957    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  50.91 
 
 		 842 aa  785    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  53.33 
 
 		 830 aa  891    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.39 
 
 		 837 aa  914    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.82 
 
 		 868 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.79 
 
 		 856 aa  906    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  58.68 
 
 		 885 aa  904    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.94 
 
 		 1231 aa  904    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.72 
 
 		 861 aa  931    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  100 
 
 		 885 aa  1763    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.32 
 
 		 870 aa  931    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  60.68 
 
 		 869 aa  973    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  49.94 
 
 		 853 aa  805    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.23 
 
 		 836 aa  896    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.38 
 
 		 831 aa  852    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.96 
 
 		 894 aa  944    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  57.24 
 
 		 852 aa  907    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.76 
 
 		 847 aa  896    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.41 
 
 		 848 aa  930    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.42 
 
 		 832 aa  882    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.29 
 
 		 950 aa  922    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  58.23 
 
 		 842 aa  959    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.54 
 
 		 710 aa  783    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.84 
 
 		 865 aa  800    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.98 
 
 		 832 aa  867    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.24 
 
 		 852 aa  907    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.92 
 
 		 837 aa  917    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.62 
 
 		 851 aa  882    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.11 
 
 		 853 aa  852    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  48.65 
 
 		 860 aa  776    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  53.62 
 
 		 891 aa  850    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  50.53 
 
 		 855 aa  791    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  52.5 
 
 		 877 aa  809    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.26 
 
 		 835 aa  891    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61 
 
 		 866 aa  971    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.24 
 
 		 852 aa  909    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.13 
 
 		 861 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  44.99 
 
 		 861 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.78 
 
 		 861 aa  622  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.74 
 
 		 876 aa  608  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.65 
 
 		 817 aa  224  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.26 
 
 		 845 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.88 
 
 		 762 aa  197  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.73 
 
 		 952 aa  194  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  31.12 
 
 		 908 aa  191  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  31.39 
 
 		 908 aa  191  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  31.38 
 
 		 908 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  33.33 
 
 		 889 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  30.61 
 
 		 908 aa  184  7e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  32.1 
 
 		 893 aa  181  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.3 
 
 		 815 aa  180  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  32.52 
 
 		 905 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  33.16 
 
 		 890 aa  176  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  30.2 
 
 		 872 aa  173  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 		 843 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  31.48 
 
 		 906 aa  172  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  27.99 
 
 		 1068 aa  169  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  29.83 
 
 		 924 aa  169  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  29.45 
 
 		 924 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  30.91 
 
 		 926 aa  167  8e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.01 
 
 		 998 aa  167  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  29.19 
 
 		 927 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.93 
 
 		 927 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  29.65 
 
 		 919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  31.28 
 
 		 924 aa  161  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 		 1068 aa  153  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.41 
 
 		 709 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  30.71 
 
 		 548 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  28.09 
 
 		 918 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.63 
 
 		 708 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  38.5 
 
 		 1055 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.46 
 
 		 694 aa  121  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.68 
 
 		 950 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  38.92 
 
 		 1026 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  34.93 
 
 		 1239 aa  119  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  30.53 
 
 		 712 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.12 
 
 		 990 aa  118  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  34.86 
 
 		 916 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.44 
 
 		 706 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  29.25 
 
 		 824 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.36 
 
 		 984 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  35.02 
 
 		 904 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  28.57 
 
 		 729 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.99 
 
 		 791 aa  115  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.62 
 
 		 799 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.04 
 
 		 917 aa  114  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  39.69 
 
 		 994 aa  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  29.27 
 
 		 723 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  33.04 
 
 		 1073 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.57 
 
 		 715 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.25 
 
 		 951 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  34.47 
 
 		 1003 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.42 
 
 		 981 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  36.6 
 
 		 1209 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.16 
 
 		 932 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.79 
 
 		 950 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>