More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1036 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1036  DNA polymerase IV  100 
 
 		 353 aa  694    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5822  DNA polymerase IV  58.41 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4310  DNA polymerase IV  53.37 
 
 		 357 aa  348  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2021  DNA polymerase IV  56.1 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  54.01 
 
 		 394 aa  328  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1793  DNA polymerase IV  55 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624184  normal  0.997558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1812  DNA polymerase IV  55 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1859  DNA polymerase IV  55 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3067  DNA polymerase IV  55.62 
 
 		 351 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2037  DNA polymerase IV  52.94 
 
 		 354 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  52.86 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0489  DNA polymerase IV  51.76 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13073  DNA polymerase IV  49.56 
 
 		 346 aa  308  8e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.498558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1153  DNA-directed DNA polymerase  44.88 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  39.31 
 
 		 410 aa  185  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  30.95 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  39.77 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  37.18 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  38.1 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.07 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  31.79 
 
 		 393 aa  176  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  39.94 
 
 		 419 aa  175  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  37.35 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  32.95 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  33.87 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  37.64 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 430 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  33.69 
 
 		 431 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  36.69 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  38.33 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  35.57 
 
 		 424 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  31.96 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  39.65 
 
 		 419 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  37.57 
 
 		 436 aa  169  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 		 416 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.5 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  34.52 
 
 		 834 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0642  DNA-directed DNA polymerase  30.46 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  34.45 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  38.08 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  36.74 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  37.83 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  31.98 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  35.96 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  39.71 
 
 		 452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  35.69 
 
 		 388 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  31.41 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  38.62 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  34.89 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  34.26 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  31.2 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  31.66 
 
 		 389 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  38.21 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  38.21 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  29.65 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  31.21 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  38.37 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 425 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  36.92 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  39.12 
 
 		 454 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  37.26 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  32.25 
 
 		 437 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  37.21 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  39.12 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  32.18 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  35.94 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 415 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  32.54 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  34.48 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  32 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3642  DNA polymerase IV  37.35 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  30.06 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2771  DNA polymerase IV  39.71 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.259095  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.89 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  35.26 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  29.79 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  34.03 
 
 		 370 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  31.96 
 
 		 391 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  29.74 
 
 		 367 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.92 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  33.63 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.89 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  35.14 
 
 		 378 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  32.46 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  30.61 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  30.17 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  30.61 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>