More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0122 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
224 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.32 
 
 
224 aa  301  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.75 
 
 
226 aa  299  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.08 
 
 
248 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
250 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.88 
 
 
248 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.88 
 
 
248 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
250 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1028  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  45.45 
 
 
250 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242243  normal  0.177071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
250 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.345481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
249 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.44 
 
 
246 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
265 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
248 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.883232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 
247 aa  188  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  46.25 
 
 
248 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
248 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
249 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
248 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 
247 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00674966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.44 
 
 
246 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649424  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
247 aa  182  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
246 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.34353  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
233 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 
248 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.3 
 
 
248 aa  175  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
233 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
233 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
233 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.13 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.13 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0296  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.63 
 
 
250 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523489  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  40.66 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  40.66 
 
 
248 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
257 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  40.66 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  40.66 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  42.39 
 
 
248 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  40.66 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  40.66 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  40.66 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  41.49 
 
 
240 aa  168  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  40.25 
 
 
246 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  40.25 
 
 
246 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  39.83 
 
 
246 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  39.83 
 
 
246 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  39.83 
 
 
246 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
241 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  40.25 
 
 
246 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
249 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0118382  normal  0.366144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  39.83 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  39.42 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  42.56 
 
 
248 aa  164  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196327  normal  0.109042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  39.18 
 
 
248 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  38.17 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  38.17 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
255 aa  161  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  38.17 
 
 
246 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.33 
 
 
247 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
234 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
246 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
240 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  42.91 
 
 
257 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 
249 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6281  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
242 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
282 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  40.91 
 
 
248 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
257 aa  158  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.58 
 
 
240 aa  157  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
253 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.67 
 
 
245 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  39 
 
 
246 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  39.18 
 
 
248 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2122  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.56 
 
 
245 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.83 
 
 
247 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 
246 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2293  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.83 
 
 
248 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000712528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.33 
 
 
245 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  40.5 
 
 
248 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.37 
 
 
246 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.08 
 
 
246 aa  155  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0642  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.18 
 
 
247 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1082  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.18 
 
 
247 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.175949  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0823  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.18 
 
 
247 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
248 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1785  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.18 
 
 
247 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.6 
 
 
246 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.93 
 
 
245 aa  154  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.34 
 
 
247 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
247 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>