118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0780 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  100 
 
 
244 aa  462  1e-129  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  34.3 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  31.28 
 
 
244 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  34.19 
 
 
244 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  32.49 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  32.91 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  33.61 
 
 
998 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  33.33 
 
 
244 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 
256 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  31.22 
 
 
972 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.62 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  28.09 
 
 
977 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  28.63 
 
 
964 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.96 
 
 
247 aa  105  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 
235 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  36.1 
 
 
247 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  31.54 
 
 
241 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  31.36 
 
 
891 aa  99.4  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.78 
 
 
240 aa  98.2  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  28.52 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  29.07 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 
234 aa  92  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 
234 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  25.79 
 
 
251 aa  89  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  25.23 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  26.77 
 
 
260 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  31.3 
 
 
242 aa  85.5  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  26.45 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  30.43 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.94 
 
 
748 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.25 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  26.27 
 
 
736 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  24 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  26.51 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 
768 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  25.2 
 
 
767 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  26.16 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  24.19 
 
 
770 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  29.26 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  25.4 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  25.9 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  31.28 
 
 
911 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  31.67 
 
 
914 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  28.08 
 
 
916 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.5 
 
 
270 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  28.08 
 
 
916 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  30.94 
 
 
920 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  25.61 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  27.72 
 
 
921 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  30.91 
 
 
373 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  30.29 
 
 
901 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  34.4 
 
 
929 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  31.65 
 
 
994 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  29.92 
 
 
906 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.47 
 
 
906 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  26.29 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  30.47 
 
 
906 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  30.47 
 
 
906 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  23.9 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.58 
 
 
416 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  34.15 
 
 
927 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  25.32 
 
 
927 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  27.86 
 
 
943 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  28.07 
 
 
922 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  26.97 
 
 
912 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  28.08 
 
 
915 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  32.2 
 
 
278 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.13 
 
 
913 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 
377 aa  45.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
401 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 
375 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  26.14 
 
 
930 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  27.56 
 
 
933 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  34.82 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  25.38 
 
 
932 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
383 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 
374 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 
377 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  26.06 
 
 
919 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  26.97 
 
 
912 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  26.97 
 
 
912 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  21.83 
 
 
1082 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  21.83 
 
 
1066 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  21.83 
 
 
1079 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>