More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1142 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  97.26 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  84.93 
 
 		 146 aa  259  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  86.99 
 
 		 146 aa  258  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  85.62 
 
 		 146 aa  255  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  85.62 
 
 		 146 aa  255  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  85.62 
 
 		 146 aa  255  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  70.55 
 
 		 215 aa  206  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  68.49 
 
 		 146 aa  206  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  70.55 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  70.55 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  70.55 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  70.55 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  70.55 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  70.55 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  65.07 
 
 		 146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  64.38 
 
 		 146 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  64.38 
 
 		 145 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  62.33 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  62.33 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  62.33 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  62.33 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  62.33 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  62.33 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  61.64 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  61.64 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  62.33 
 
 		 146 aa  183  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  60.54 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  60.27 
 
 		 146 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  59.59 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  59.59 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  58.9 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  61.9 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  71.3 
 
 		 118 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  44.22 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  45.58 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  41.38 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  39.19 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  42.2 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  35.58 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  30.94 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  33.33 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  35.9 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  31.51 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  30.94 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.08 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  28.99 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  29.45 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>