63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5624 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  94.08 
 
 		 152 aa  297  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  48.55 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  49.58 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  47.5 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  45.6 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  46.28 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  45.6 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  39.86 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  44 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  42.45 
 
 		 173 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  41.32 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  47.11 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  45.61 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  41.32 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  39.74 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  40 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  41.53 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  41.53 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  42.24 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  41.53 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  38.33 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  37.59 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  41.46 
 
 		 161 aa  97.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  45.45 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  41.67 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  37.4 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  40.16 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  41.75 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  36.62 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  36 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  38.94 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  34.94 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  33.57 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  31.88 
 
 		 235 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  27.74 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  33.94 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  34.95 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  35.19 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  35.19 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  32.46 
 
 		 255 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  34.04 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  37.63 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  35.79 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  33.04 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  33.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  32.48 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  36.26 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  37.21 
 
 		 224 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  35.92 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  37.25 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  32.14 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  32.63 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30.28 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  30.53 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  37.25 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  34.45 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  30.3 
 
 		 347 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  34.65 
 
 		 545 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  28.42 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  26.4 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.97 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>