More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3775 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  99.32 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  95.92 
 
 		 294 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  95.92 
 
 		 294 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  95.92 
 
 		 294 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  95.92 
 
 		 294 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  95.58 
 
 		 294 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  88.44 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  88.44 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  88.44 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  88.44 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  88.1 
 
 		 294 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  88.1 
 
 		 294 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  88.1 
 
 		 294 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  84.35 
 
 		 293 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  84.01 
 
 		 293 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  87.76 
 
 		 294 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3949  polyprenyl synthetase  82.88 
 
 		 291 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  72.41 
 
 		 294 aa  374  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  63.45 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0881  farnesyl-diphosphate synthase  69.66 
 
 		 294 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  58.76 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2427  Polyprenyl synthetase  63.88 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  61.99 
 
 		 302 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2034  Polyprenyl synthetase  62.3 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2222  geranyltranstransferase  63.73 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  62.2 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  59.79 
 
 		 296 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  53.72 
 
 		 300 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  59.79 
 
 		 327 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  58.25 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  54.18 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  54.18 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0955  Polyprenyl synthetase  63.23 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  53.85 
 
 		 322 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  60.14 
 
 		 311 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  57.91 
 
 		 298 aa  285  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  51.72 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  56.31 
 
 		 297 aa  281  9e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  59.17 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  51.36 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  52.4 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  56.52 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  53.67 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  57.58 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  56.31 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  51.19 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  54.28 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2876  polyprenyl synthetase  60.22 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  55.43 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  54.74 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  46.58 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  54.14 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  49.32 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  53.79 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  46.98 
 
 		 293 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  54.61 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  53.79 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  53.22 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  43.05 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  51.36 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  45.15 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  53.79 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  52.94 
 
 		 295 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  52.94 
 
 		 295 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  53.45 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  53.85 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  45.21 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  45.55 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  47.44 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2014  farnesyl-diphosphate synthase  59.03 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319627  hitchhiker  0.00305409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  47.58 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  43.49 
 
 		 294 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  45.33 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  44.93 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  45.2 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  45.91 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  47.6 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  48.04 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  45.74 
 
 		 293 aa  232  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  44.74 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  53.36 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  44.68 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  43.64 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  42.35 
 
 		 293 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  47.04 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  45.79 
 
 		 299 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>