More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3449 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  90.5 
 
 		 466 aa  796    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  90.97 
 
 		 466 aa  783    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3449  amidase  100 
 
 		 467 aa  920    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  98.29 
 
 		 467 aa  904    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  90.97 
 
 		 466 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3471  amidase  62.5 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3666  amidase  60.13 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1896  amidase  61.51 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4149  amidase  62.58 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0894  amidase  63.28 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0413  amidase  60 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6296  amidase  60.17 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1407  amidase  59.74 
 
 		 473 aa  501  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  50.21 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6669  amidase  49.26 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3556  amidase  51.17 
 
 		 473 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6072  amidase  48.83 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  39.57 
 
 		 499 aa  302  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2400  indoleacetamide hydrolase  43.58 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1619  amidase  42.03 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445224  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1577  amidase  39.14 
 
 		 478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  40.65 
 
 		 524 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  41.47 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  34.57 
 
 		 469 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0468  amidase  41.37 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0410275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.12 
 
 		 472 aa  209  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  38.62 
 
 		 473 aa  204  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  34.35 
 
 		 477 aa  203  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.4 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  35.15 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  35.86 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  31.46 
 
 		 495 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  34.13 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  35.65 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  33.88 
 
 		 480 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  36.69 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  42.33 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  35.73 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  33.33 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.76 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  35.12 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.04 
 
 		 485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  34.24 
 
 		 467 aa  163  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  32.84 
 
 		 482 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  39.26 
 
 		 475 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  30.6 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.37 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  31.68 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  31.39 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  32.15 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  35.28 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.91 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  35.42 
 
 		 468 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  30.06 
 
 		 475 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  32.69 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  33.07 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.79 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  32.76 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  30.63 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  34.48 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  34.69 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.86 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  32.01 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  41.42 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.9 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  32.83 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  30.12 
 
 		 494 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.33 
 
 		 491 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.82 
 
 		 483 aa  154  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  31.64 
 
 		 485 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  32.04 
 
 		 492 aa  153  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  32.76 
 
 		 498 aa  153  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.99 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  32.33 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  34.16 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  26.48 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  30.74 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  33.05 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  30.74 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  30.74 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  29.48 
 
 		 468 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  31.37 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  34.65 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  31.47 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.86 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  31.91 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  31.55 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02060  amidase, putative  31.76 
 
 		 556 aa  147  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  39.23 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  35.52 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  27.7 
 
 		 549 aa  147  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  30.61 
 
 		 494 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  30.1 
 
 		 491 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  32.33 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  31.53 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  32.31 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  38.08 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  32.32 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  31.53 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.67 
 
 		 479 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>